Browsing by Author "Keskin, Cumali"

Now showing 1 - 20 of 69

Acanthus dioscoridis L. var. dioscoridis’ in total yağ asidi, fosfolipit ve triaçilgliserol kompozisyonlarının belirlenmesi
(2014) Keskin, Cumali; Kaçar, Semra; Kaçar, Semra; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü; Department of Nutrition and Dietetics/ Beslenme ve Diyetetik Bölümü
Özet: Yağ asitleri fosfolipitler, trigliseritler ve monogliseritler gibi lipitlerin temel bileşenleridir. Doymuş, tekli doymamış veya çoklu doymamış olabilirler. Acanthus dioscoridis’in total lipit, fosfolipit ve triaçilgliserol yağ asidi kompozisyonları gaz kromatografisi (GC) ile belirlendi. A. dioscoridis’in total lipit ve TLC yöntemiyle ayrılan fosfolipit ve triaçilgliserol fraksiyonlarında 9 farklı yağ asidi tespit edildi. A. dioscoridis’in toprak üstü kısımlarından ekstrakte edilen total lipit, fosfolipit ve triaçilgliserol fraksiyonlarından elde edilen metil esterlerinde; doymuş yağ asitleri içinde C14:0, C15:0, C16:0, C17:0 ve C18:0 tekli doymamış yağ asitleri içinde C16:1ω-7 ve C18:1 ω-9, çoklu doymamış yağ asitleri içinde C18:2ω-2 ve C18:3 ω-3 temel bileşenler olarak belirlenmiştir. Total lipit, fosfolipit ve triaçilgliserolde sırasıyla doymuş yağ asitlerinden majör bileşen olarak palmitik asit (C16:0), stearik asit (C18:0) ve miristik asit (C14:0) tespit edildi. Total doymamış yağ asitleri (∑SFA) (%42.66) en fazla fosfolipit fraksiyonunda saptandı. Oleik asit (C18:1n-9) (%26.33) en fazla triaçilgliserol fraksiyonunda tespit edildi. Palmitoleik asit (C16:1n-7) (%13.67) ve total MUFA (%40.00) oranı; triaçilgliserol fraksiyonunda diğerlerine oranla belirgin miktarda yüksek bulundu. Temel yağ asitlerinden linoleik asit (C18:2n-6) (%16.26) ve linolenik asit (C18:3n-3) (%35.25) yüksek oranda total lipitte saptandı. Total doymamış yağ asitleri (∑PUFA) en fazla total lipitte (%51.51) diğer taraftan en düşük triaçilgliserol fraksiyonunda (%35.45) saptandı. Sonuç olarak A. dioscoridis’in total lipit, fosfolipit, triaçilgliserol fraksiyonlarının kalitatif olarak benzer olduğu fakat kantitatif olarak farklılık gösterdiği tespit edilmiştir.
Citation - WoS: 4
Citation - Scopus: 7
Adsorption Performance of bacillus Licheniformis Sp. Bacteria Isolated From the Soil of the Tigris River on Mercury in Aqueous Solutions
(Taylor & Francis Ltd, 2022) Acay, Hilal; Keskin, Cumali; Acay, Hilal; Keskin, Cumali; Yıldırım, Ayfer; Department of Nutrition and Dietetics/ Beslenme ve Diyetetik Bölümü; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
Mercury is known to be one of the most toxic heavy metals in the environment and is released into the water systems in significant quantities through natural events and industrial process activities. Many chemical materials are used as adsorbents in the removal of toxic metals from the environment and wastewaters. However, using microorganisms as bio-sorbents instead of chemical materials has become common recently due to their low cost, easy availability and presence in nature. In this study, Bacillus licheniformis in the soil isolated from the Tigris River was used as bio-sorbent. The mercury (Hg(II)) absorption behaviour of Bacillus licheniformis bacteria (BLB) was investigated using inductively coupled plasma mass spectrometry. The effects of equilibrium of adsorption time, temperature, adsorbent dosage and pH on the adsorption of Hg (II) onto BLB were determined. The maximum adsorption capacity of Hg (II) onto BLB was determined as 82.12 mg/g (T = 25 degrees C, pH 5, Co = 50 mg/L, m = 25 mg). The BLB was characterised using Fourier transform infrared spectroscopy analysis, thermal gravimetric analysis/differential thermal analysis, scanning electron microscopy analysis and energy-dispersive X-ray spectroscopy analysis. In addition, pseudo-first-order and pseudo-second-order kinetic models were applied. The equilibrium data for the adsorption of Hg(II) onto BLB were examined by the Langmuir and Freundlich isotherm models. The activation energy was calculated using the pseudo-second-order rate constant. These results suggested the BLB can be used as an efficient adsorbent for the removal of Hg(II) metal ions from wastewater. When the results of bio-sorption studies were examined, it was found that the bio-sorbent could be reused easily. The present study suggests that microorganism bio-sorbents are useful for the efficient removal of mercury from aqueous solutions.
Citation - Scopus: 0
Advances in Nano Vaccines: Covid-19
(Bentham Science Publishers, 2023) Keskin, Cumali; Nasibova, A.; Baran, Mehmet Fırat; Selimoğlu, A.; Baran, M.F.; Keskin, C.; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
Nanovaccines are considered a new approach in vaccination methodology specially for Covid-19 infection. Nanovaccines are more effective than conventional vaccines; Because ofhumoral and cellular immune responses which are simultaneously induced. Nano vaccines are assumed to upregulate the immune system as well as infection prevention. They are probably promising candidates for chronic autoimmune diseases such as multiple sclerosis, rheumatoid arthritis, AIDS, and COVID-19 infectious. Based on this, we will describe the different working mechanisms of nanoparticles. In addition, applicable nano vaccines which have been approved for COVID-19 therapy Covid 19 are described. Antigen-carrying nanoparticles can affect the immune response and significantly enhance cell-T cytotoxic response. Nanoscale particles can improve vaccine efficiency because of their biomedical benefits. These properties include Small size, which allows better penetration into tumors and more half-life tumor cells. Current vaccines, however, are required to re-formulate almost because of gradual antigen modifications. More ever these vaccines do not protect against mutations and the low half-life of current vaccines due to limitations of current technologies. Nano vaccine formulation improvements have been required to induce a widespread and potent immune response. In this review, we provide an overview ofthe types and applications of nanoparticles in vaccines and their outstanding properties that made them alternatives for Covid-19 treatment. © 2023, Bentham Books imprint.
Alcea Striata Ssp. Striata (Hatmi) Sulu Özütünden Selenyum Nanopartıküllerin Biyosentezi, Karakterizasyonu, Antimikrobiyal ve Sitotoksik Aktivitelerinin Belirlenmesi
(2024) Keskin, Cumali; Keskin, Cumali; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
Küçük boyutları, güçlü biyolojik aktiviteleri, biyoyararlanımları, düşük toksisiteleri ve yaygın uygulamaları nedeniyle nanopartiküller büyük ilgi alanı hâline gelmiştir. Sentez aşamasında tehlikeli kimyasalların kullanılması, maliyetin yüksek olması ve oluşturulan parçacıkların kararsızlığı nedeniyle son yıllarda fiziksel ve kimyasal yaklaşımlara alternatif olarak 'yeşil sentez' olarak bilinen bir teknik ortaya çıkmıştır. Yeşil sentezde mantar, maya, bitki ekstraktları ve bakteri kültürü filtratı gibi biyolojik kaynaklardan sıklıkla yararlanılmaktadır. Bu biyolojik kaynaklar, altın, gümüş, çinko, selenyum ve daha fazlası dahil olmak üzere çok çeşitli metallerin oluşturulmasında kullanılmış olup, bunların hepsi hızla üretilmektedir. İnsan vücudu eser element olarak selenyuma ihtiyaç duyar. Biyolojik kaynaklardan türetilen selenyum nanopartiküllerinin (SeNP'ler) fiziksel, kimyasal ve biyolojik özelliklerinin inorganik ve organik selenyumdan farklı olduğu bulunmuştur. Bu çalışmada biyolojik kaynak kullanarak yeşil sentez yöntemiyle Alcea striata ssp. striata (hatmi) bitkisinin sulu özütünden selenyum nanopartikülleri (SeNP) sentezlendi. Sentezlenen SeNP'ler Fourier Transform İnfrared Spektroskopisi (FT-IR), UV-Görünür Işık Spektrofotometresi (UV-vis), X-Işını Kırınımı (XRD), Taramalı Elektron Mikroskobu, Geçirimli Elektron Mikroskobu (TEM), Enerji Dağılımlı X-Işını (EDAX), Atomik Güç Mikroskobu (AFM), Zeta Potansiyel ve Zeta Dağılım Analizi gibi spektroskopik yöntemler kullanılarak SeNP'lerinin oluşumu doğrulandı. Sentezlenen selenyum nanopartiküllerin mikroorganizmalar üzerindeki antimikrobiyal etkileri ve sağlıklı ve kanser hücreleri üzerinde sitotoksik etkileri MTT metodu kullanılarak incelenmiştir.
Amygdalus Communis (badem) Meyvesinden Elde Edilen Özütlerin Bazı İn Vitro Biyolojik Aktivitelerinin, Kimyasal ve Pestisit Kompozisyonlarının Araştırılması
(2024) Keskin, Cumali; Baran, Ayşe; Baran, Mehmet Fırat; Baran, Mehmet Fırat; Çetik Yıldız, Songül; Tarhan, Rozerin; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
Amygdalus communis (A. communis) yüksek düzeyde protein ve doymamış yağ asitlerinden oluşur ve bu da onları doğal kaynakların sınırlı olması gereken diyet beslenmesinde faydalı kılar. Bu çalışmada badem meyvesinden elde edilen kloroform ve metanol özütlerinin antioksidan, antikolinesteraz, antimikrobiyal özellikleri, kimyasal bileşen miktarı ile ağır metal kompozisyonu ve pestisit kalıntı miktarları araştırıldı. A. communis meyvesinde en yüksek toplam fenolik bileşen ve flavonoid içeriğin kloroform özütünde olduğu ayrıca kloroform özütünün DPPH radikal söndürme aktivitesinin daha yüksek olduğu belirlendi. A. communis meyve kloroform ve metanol özütlerinin Escherichia coli ve Staphylococcus aureus bakteri suşları ve Candida albicans mayasının üremesi üzerinde standart antibiyotikler ile kıyaslandığında düşük konsantrasyonlarda oldukça güçlü inhibisyona sebep olduğu belirlendi. A. communis meyve metanol ve kloroform özütlerinin kimyasal bileşen içerikleri LCMS/MS kullanılarak belirlendi. Metanol (Me-OH) özütünde ana bileşenlerin sırasıyla sitrik asit, şikorik asit ve 4-Hidroksibenzoik asit kloroform özütünde ise 4-Hidroksibenzoik asit, p-kumarik asit ve klorogenik asit olduğu belirlendi. A. communis meyve numunesi için pestisit kalıntı analizi GC-MS ve LCMS-MS kullanılarak yapıldı. Test edilen numune içeriğinde Deltametrin kalıntısının varlığı belirlendi. Elde edilen veriler değerlendirildiğinde A. communis meyvesinin zengin biyokimyasal içeriği ve güçlü antibakteriyel, antioksidan ve antikolinesteraz enzim inhibisyon kapasitesi ile biyomedikal ve gıda endüstrilerinde potansiyel uygulamalara sahip olması beklenmelidir.
Citation - WoS: 6
Citation - Scopus: 5
Analysis of bioactive compounds using LC-ESI-MS/MS, cytotoxic, antimicrobial effects, and enzyme activities from Cyclotrichium origanifolium
(Wiley Online Library, 2022) Aktepe, Necmettin; Keskin, Cumali; Baran, Ayşe; Baran, Mehmet Fırat; Keskin, Cumali; Taşkin, Abdullah; Yavuz, Ömer; Demirtaş, İbrahim; Oğuz, Ercan; Jahan, Israt; Department of Nursing / Hemşirelik Bölümü; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
Cyclotrichium origanifolium is a medicinal plant belonging to the Lamiaceae family. In this study, phenolic content analysis, antimicrobial effects, and cytotoxic effects of extracts of C. origanifolium were investigated. In the extracts, phenolic compound analysis by the liquid chromatography–electrospray ionization– tandem mass spectrometry method, antimicrobial effect by the minimum inhibition concentration method, and cytotoxic effect on human dermal fibroblasts (HDF), glioblastoma cell (U87), ovarian adenocarcinoma cell (Skov-3), and human colorectal adenocarcinoma cell (CaCo-2) cancer cell lines were investigated. Cytotoxicity analyses were performed by the MTT method. In addition, the GST and AChE enzyme activities of the extracts were also measured. Around 18 compounds were detected in both the methanol and ethanol extract. It was found that the best antimicrobial effect on Gram-negative Pseudomonas aeruginosa was on methanol extract, while the ethanol extract was on Candida albicans fungus (respectively, 2.50mg/ml, 5.0 μg/ml). A 500μg/ml of methanol extract has been shown to have cytotoxic activity high effect on HDF cells. GST and AChE activity were found to decrease in a concentration-dependent manner.
Citation - WoS: 0
Analysis of Bioactive Compounds Using Lc-esi-ms/Ms, Cytotoxic, Antimicrobial Effects, and Enzyme Activities From Cyclotrichium Origanifolium (Vol 101, Pg 740, 2023)
(Wiley, 2024) Aktepe, Necmettin; Keskin, Cumali; Atalar, M. N.; Baran, F.; Baran, Ayşe; Taskin, A.; Jahan, I; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü; Department of Nursing / Hemşirelik Bölümü
Anchusa officinalis yapraklarından gümüş nanopartiküllerin ((AgNPs) sentezi, karekterizasyonu ve antimikrobiyal özelliklerinin belirlenmesi
(Mardin Artuklu Üniversitesi, 2022) Baran, Mehmet Fırat; Keskin, Cumali; Baran, Mehmet Fırat; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
Anchussa officinalis L. Boragineceae familyasına aittir bir veya iki yıllık otsu bir bitkidir. Güneşli ve nemli toprakları seven Anchussa officinalis ülkemizde geniş bir yayılım gösterir. Bu çalışmada, Anchussa officinalis bitkisinin yapraklarından elde edilen özütten biyolojik yolla sentezlemiş olduğumuz gümüş nanopartiküllerin yapısal özellikleri (AgNP'ler) karekterize edildi ve patojen mikroorganizmalar üzerindeki antimikrobiyal aktiviteleri araştırıldı. Gümüş nanopartiküllerin (AgNP'ler) karakterizasyon işlemleri için Ultra Viyoleve Görünür Bölge Spektrokopisi (UV-Vis), X-Işını Difraktometresi (XRD), Transmisyon Elektron Mikroskopu-Enerji dağılımlı X-Ray Dedektörlü (SEM-EDX), Fourier Dönüşümlü Kızıl ötesi Spektroskopisi (FIT-IR), Termogravimetrik ve Diferansiyel Termal Analiz Cihazı (TGA/DTA), Zeta Potansiyel Analiz Cihazları verileri kullanıldı. UV-Vis verileri incelendiğinde test edilen numunelerin 466 nm'de belirgin plasmon rezonansı verdiği belirlendi. XRD ve SEM-EDX verileri incelendiğinde AgNP'lerin element kompozisyonun büyük oranda gümüşten oluştuğu, kübik ristal yapıda ve ortalama 27.06 nm boyutunda olduğu tespit edildi. Zeta potansiyel analizi sonucunda elde edilen AgNP'lerin yüzey yükleri (–) 21.2 mV olarak belirlendi. AgNP'lerin ve standart olarak kullanılan antibiyotiklerin patojen gram (-) ve gram (+) pozitif bakteri ve Candida albicans mayası üremesi üzerindeki inhibisyon etkisi MİK yöntemi ile belirlendi. Anchussa officinalis bitkinin yapraklarından ürettiğimiz AgNP'lerin antimikrobiyal aktivitelerinin standart antibiyotiklerle kıyaslandığında daha etkili olduğu belirlendi.
Citation - WoS: 1
Citation - Scopus: 2
Antioxidant, Ache Inhibitory, and Anticancer Effects of Verbascum Thapsus Extract
(C M B Assoc, 2023) Keskin, Cumali; Baran, Ayşe; Valioglu, Ferzane; Teng, Lei; Atalar, Mehmet Nuri; Keskin, Cumali; Beilerli, Aferin; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
Verbascum thapsus (Mullein) is a medicinal plant used in folk medicine to treat various ailments. For this study, the biological functions of Verbascum thapsus (VT) methanol extract were determined in vitro. The plant's methanol extract was created through the maceration process. The phytochemical composition of plant extracts was investigated using liquid chromatography-electrospray ionization tandem mass spectrometry. The antioxidant capacity of the extract was determined using the 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazil (DPPH radical) and 2,2-azinobis (3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid) (ABTS radical). Cell lines Caco-2 (human colorectal adenocarcinoma cells), LNCaP (Lymph Node Carcinoma of Prostate), and HEK293 (Human embryonic kidney 293 cells) were used to model colon, prostate, and non-cancerous cells. The cytotoxic activity of the plant extract on the proliferation of these cells was determined by the MTT (3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide, a tetrazole) assay protocol. VT extract showed moderate DPPH and ABTS radical scavenging activities at 30 mg/ml concentration. With this, VT extract was determined to inhibit acetylcholinesterase (AChE) enzyme and had strong cytotoxic activity on cancerous cell lines. In addition, our findings clearly showed that the plant extract had greater cytotoxic activity on the viability of cancerous cells compared to non-cancerous (Human embryonic kidney cells; HEK293) cells. The current findings showed that V. thapsus might be a promising anti-cancer medication candidate for the treatment of human colorectal adenocarcinoma and colon cancer, as well as a good source antioxidans. Copyright: (c) 2023 by the C.M.B. Association. All rights reserved.
Citation - Scopus: 20
Antioxidant, anticancer and anticholinesterase activities of flower, fruit and seed extracts of hypericum amblysepalum HOCHST
(Asian Pacific Organization for Cancer Prevention, 2015) Keskin, Cumali; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
Background: Cancer is an unnatural type of tissue growth in which the cells exhibit unrestrained division, leading to a progressive increase in the number of dividing cells. It is now the second largest cause of death in the world. The present study concerned antioxidant, anticancer and anticholinesterase activities and protocatechuic, catechin, caffeic acid, syringic acid, p-coumaric acid and o-coumaric concentrations in methanol extracts of flowers, fruits and seeds of Hypericum amblysepalum. Materials and Methods: Antioxidant properties including free radical scavenging activity and reducing power, and amounts of total phenolic compounds were evaluated using different tests. Protocatechuic, catechin, caffeic acid, syringic acid, p-coumaric acid and o-coumaric concentrations in extracts were determined by HPLC. Cytotoxic effects were determined using the MTT test with human cervix cancer (HeLa) and rat kidney epithelium cell (NRK-52E) lines. Acetyl and butyrylcholinesterase inhibitory activities were measured by by Ellman method. Results: Total phenolic content of H. amblysepalum seeds was found to be higher than in fruit and flower extracts. DPPH free radical scavenging activity of the obtained extracts gave satisfactory results versus butylated hydroxyanisole and butylated hydroxytoluene as controls. Reducing power activity was linearly proportional to the studied concentration range: 10-500 µg/mL LC50 values for H. amblysepalum seeds were 11.7 and 2.86 respectively for HeLa and NRK-52E cell lines. Butyryl-cholinesterase inhibitory activity was 76.9 ± 0.41 for seed extract and higher than with other extracts. Conclusions: The present results suggested that H. amblysepalum could be a potential candidate anti-cancer drug for the treatment of human cervical cancer, and good source of natural antioxidants.
Artemisia Absinthium Bitki Ekstraktından Altın Nanopartiküllerin Çevre Dostu Hızlı Sentezi ve Antimikrobiyal Aktivitelerin Uygulanması
(2021) Keskin, Cumali; Baran, Mehmet Fırat; Baran, Ayşe; Baran, Ayşe; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
Nanopartiküller, üstün özelliklerinden dolayı birçok alanda kullanılmaktadır. Son zamanlarda, bu parçacıkların çevre dostu sentez yöntemleri kullanılarak üretilmesi çok popüler hale gelmiştir. Bu bağlamda, bu çalışmada, altın nanopartiküller (AuNP'ler), Artemisia absinthium'un (pelin otu) yeşil yaprak özütü ile hızlı ve çevre dostu bir yöntem kullanılarak sentezlenmiştir. AuNP'lerin tane boyutu Debye-Scherrer denklemine göre 13.40 nm olarak belirlendi. AuNP'lerin test edilen mikroorganizmaların büyümesi üzerindeki inhibe edici etkileri, minimum inhibe edici konsantrasyon (MİC) yöntemi ile belirlenmiştir. MİC, bir mikroorganizmanın büyümesini engelleyen bir antimikrobiyal maddenin minimum konsantrasyonu olarak tanımlanmaktadır. Elde edilen AuNP'ler, sırasıyla 0.250, 0.125, 0.125, 0.033 ve 0.66 mg mL-1 konsantrasyonlarında S. aureus, S. pyogenes, E. coli, P. aeruginosa suşları ve C. albicans mayası üzerinde önleyici etkiler göstermiştir.
Assessment Of The Antimicrobial, Antioxidant And Cytotoxic Activities Of The Wild Edible Mushroom Pleurotus Eryngii From Hakkari, Turkey
(2017) Acay, Hilal; Dündar, Abdurrahman; Keskin, Cumali; Kaçar, Semra; Department of Nutrition and Dietetics/ Beslenme ve Diyetetik Bölümü; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
Abstract: Mushroom is an important source of natural compounds with acknowledged bioactivity. Pleurotus eryngii, in particular, is widely recognized for its organoleptic quality and favorable healthy effects, being commercially produced in great extent. The present study is just for evaluating the antioxidant capacity (scavenging DPPH radicals, reducing power, Total antioxidant activity by β-carotene-linoleic acid metod, Chelating effect on ferrous ions, superoxide anion radical scavenging activity ), antimicrobial effects (by using the disc diffusion method) and insufficiently studied cytotoxic activity (using PC-3 cell lines) of Pleurotus eryngii by using various solvent systems. For this reason; obtained extracts of the mushroom applying hexane, ethylacetate and methanol respectively were tested with in its biologic activities. As a result, The highest total antioxidant activity by β -carotene-linoleic acid metod was identified in methanol extract (63.62 mg /ml). The highest DPPH scavenging activity was obtained from ethyl acetate extract with 88.81 mg/ml. EDTA is used as standard in methal chelating activity. The highest metal chelating activity of Pleurotus eryngii identified in hexane (88,1 mg /ml) and ethylacetate (88.84 mg /ml) extracts. Additionally, in most of studied tests antioxidant activity of the mushroom increased with increasing concentration. On the other hand, the highest antimicrobial activity was obtained against Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853 (11 mm) in ethyl acetate extract. However, the best antimicrobial activities were observed in hexane and methanol extracts for other tested microorganism. It was not determined any antimicrobial activity against Escherichia coli ATCC 25922. It has been found that the potential of cytotoxic activity is depended on concentration and solvent type of extracts. Ethyl acetate extract showed significant inhibitory value at the concentrations of 530 µg/ml (86.20 %) against PC-3 cell lines. Using methanol extract, the maximun inhibition was observed at concentration of 680 µg/ml with value of 51.86 %. Overall, the mushroom used as a daily nutrient could be a source for new drug developments and a kind of treatment in cancer therapies, and also, organic extracts of Pleurotus eryngii may contain substances that stimulate bioactivity
Astragalus diphtherites FENZL var. diphtherites ve Astragalus gymnalopecias RECH. FIL’in Gövde ve Kök Kısımlarından Farklı Çözücüler ile Elde Edilen Özütlerin İnvitro Antioksidan ve Antimikrobiyal Özelliklerinin Belirlenmesi
(2018) Keskin, Cumali; Hasan Çetin Özen; Zuhal Toker; Göksel Kızıl; Murat Kızıl; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
Bu çalışmanın amacı farkı polariteye sahip çözücü serilerinden geçiren Astragalus diphtherites var. diphtherites (A. diphtherites) ve Astragalus gymnalopecias (A. gymnalopecias) türlerinin gövde ve kök kısımlarının antioksidan ve antimikrobiyal özelliklerinin araştırılmasıdır. Antioksidan özellikleri belirlemek için özütlerin total fenolik, total flavonoid, DPPH, metal şelatlama, indirgeme gücü ve hidroksi radikalini söndürme aktiviteleri test edildi. En yüksek total fenolik bileşen miktarı A. diphtherites’ de gövdede metanol, kökte ise aseton özütünden elde edilirken A. gymnalopecias’ ta gövdede metanol kökte ise etil asetat özütünde tespit edildi. A. diphtherites ve A. gymnalopecias’ ta en yüksek total flavonoid miktarları ve indirgeme gücü aktiviteleri gövdede aseton kökte ise etil asetat özütlerinden elde edildi. A. diphtherites için en yüksek DPPH radikalini söndürme aktivitesi, gövdede metanol kökte ise aseton özütünde, A. gymnalopecias’ ta gövdede metanol kökte ise etil asetat özütünde tespit edildi. A. diphtherites’ te gövde kısmından elde edilen metanol ve kök kısmından elde edilen hekzan özütleri, A. gymnalopecias’ ta ise gövde ve kök kısımlarının metanol özütleri en yüksek metal şelatlama aktivitesi gösterdi. Her iki türde de gövde ve kök etil asetat özütleri en yüksek hidroksil radikali söndürme aktivitesi gösterdi. A. gymnalopecias’ın gövde aseton ve metanol özütlerinin Streptococcus pyogenes’in büyümesi üzerinde inhibisyon etkisine sahip olduğu tespit edildi.
Citation - WoS: 5
Citation - Scopus: 5
Biochemical components, enzyme inhibitory, antioxidant and antimicrobial activities in endemic plant Scilla mesopotamica speta
(Wiley, 2021) Aktepe, Necmettin; Keskin, Cumali; Baran, Ayşe; Baran, Mehmet Fırat; Akmeşe, Şükrü; Akmeşe, Şükrü; Department of Nursing / Hemşirelik Bölümü; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
In this study, in vitro antioxidant, antimicrobial, anticholinesterase and phenolic profile of different solvent extracts of Scilla mesopotamica speta were determined in detail. In vitro antioxidant activities and total phenolic and flavonoid contents of plant extracts obtained with different solvents were tested in terms of 2.2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH) free radical scavenging activities. The highest total phenolic and total flavonoid contents were determined in the ethyl acetate extract (62.24 mu g GAE/mg) and chloroform extract (87.72 mu g QE/mg) respectively. The highest DPPH radical scavenging activity was detected in ethyl acetate extracts. Antimicrobial and antifungal activities were investigated by MIC method. The inhibitory activities of the extracts on the acetyl cholinesterase enzyme were investigated. Liquid chromatography (LC) tandem mass spectrometry LC-MS/MS was used to determine the phenolic component content of extracts. Thirty-one different components were identified in the analyses and their amounts were measured. Practical applications Scilla mesopotamica speta is an endemic and medicinal plant. It was determined that the extracts of this plant had a very rich content in terms of phenolic compounds, especially caffeic and ferulic acids. However, this plant was remarkable for its antioxidant, anticholinesterase, and antimicrobial activities. Considering the strong antioxidant, antimicrobial, and enzyme inhibition activities of the Scilla mesopotamica speta it can be suggested as a source of anticancer, antimicrobial, and antiviral drugs.
Citation - WoS: 58
Citation - Scopus: 67
Biosynthesis, characterization, and investigation of antimicrobial and cytotoxic activities of silver nanoparticles using Solanum tuberosum peel aqueous extract
(Elsevier, 2023) Keskin, Cumali; Baran, Ayşe; Baran, Mehmet Fırat; Keskin, Cumali; Baran, Ayşe; Baran, Mehmet Fırat; Eftekhari, Aziz; Aytuğ Ava, Canan; İrtegün Kandemir, Sevgi; Cebe, Deniz Barış; Dağ, Beşir; Beilerli, Aferin; Khalilov, Rovshan; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
Metallic nanoparticle biosynthesis is thought to offer opportunities for a wide range of biological uses. The green process of turning biological waste into utilizable products gaining attention due to its economical and eco-friendly approach in recent years. This study reported the ability of Solanum tuberosum (ST) peel extract to the green synthesis of non-toxic, stable, small-sized silver nanoparticles without any toxic reducing agent utilizing the phytochemical components present in its structure. UV-visible spectroscopy, X-ray diffraction analysis, Fourier transform infrared spectroscopy, flourier scanning electron microscopy, atomic force microscopy, transmission electron microscopy, and energy dispersive analysis X-ray confirmed the biosynthesis and char-acterization of silver nanoparticles. Also, dynamic light scattering and thermogravimetric ana-lyses showed stable synthesized nanoparticles. The antibacterial activity of the biosynthesized silver nanoparticles was evaluated against four different bacterial strains, Escherichia coli (E. coli), Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa), Staphylococcus aureus (S. aureus) Bacillus subtilis (B. subtilis), and a yeast, Candida albicans (C. albicans) using the minimum inhibitory concen-tration technique. The cytotoxic activities were determined against Human dermal fibroblast (HDF), glioblastoma (U118), colorectal adenocarcinoma (CaCo-2), and human ovarian (Skov-3) cell lines cancer cells using MTT test. The nanoparticle capping agents that could be involved in the reduction of silver ions to Ag NPs and their stabilization was identified using FTIR. Nano -particles were spherical in shape and had a size ranging from 3.91 to 27.07 nm, showed crys-talline nature, good stability (-31.3 mV), and the presence of capping agents. ST-Ag NPs significantly decreased the growth of bacterial strains after treatment. The in vitro analysis showed that the ST-Ag NPs demonstrated dose-dependent cytotoxicity against cell lines. Based on the data, it is feasible to infer that biogenic Ag NPs were capped with functional groups and demonstrated considerable potential as antibacterial and anticancer agents for biomedical and industrial applications.
Citation - WoS: 0
Citation - Scopus: 0
Can Quercetin Reduce Arsenic Induced Toxicity in Mouse Balb/C 3t3 Fibroblast Cells ? A Study Involving in Vitro, Molecular Docking, and Adme Predictions
(Bmc, 2025) Unsal, Velid; Keskin, Cumali; Oner, Erkan; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü; Department of Nutrition and Dietetics/ Beslenme ve Diyetetik Bölümü
This study aimed to investigate the protective effect of quercetin against arsenic-induced oxidative damage, inflammation, and apoptosis in mouse BALB/c 3T3 fibroblast cells (NIH-3T3). Arsenic at different concentrations of 0.05 mu M (low), 0.5 mu M (medium), 10 mu M (high) doses were used to induce toxicity, while 120 mu m quercetin was used for treatment. MTT and LDH analyses were performed to determine the effect of arsenic and quercetin on cell viability, while oxidative stress markers and antioxidant enzyme activities were measured by spectrophotometric method. TNF-alpha and IL-1 beta levels were measured by the ELISA method, Autodock programs were used for molecular docking studies. In addition, computer-based analyses of quercetin and succimer molecules were performed using SwissADME web tools. TNF-alpha (PDB ID: 2AZ5), IL-1 beta (PDB ID: 1ITB), Caspase3 (PDB ID: 2XYG), Bax (PDB ID: 4S0O), SOD (PDB ID:1CBJ), GSH-Px (PDB ID: 1GP1) and Bcl-2 (PDB ID: 1G5M) crystal structures were obtained from the Protein Data Bank. Bax and Bcl-2 levels of apoptotic genes and mRNA expression levels of Caspase-3 activity were measured using the QRT-PCR technique. TUNEL staining was performed to determine DNA fragmentations, while DAPI staining was done to visualise nuclear modifications. Quercetin has been found to significantly reduce oxidative stress, inflammation, and apoptosis in cells and exert anti-apoptotic effects. Molecular docking studies revealed quercetin shows good binding affinity with molecules with SOD, GSH-Px, Bax, Bcl-2, Caspase-3, TNF-alpha and IL-1 beta structures, and has been observed to bind with Bax and Bcl-2 with molecular docking scores of -7.5 and - 7.7 kcal/mol, respectively. These findings are supported by results showing that quercetin is effective in anti-apoptotic and anti-inflammatory processes in arsenic-induced cells under in vitro conditions. In addition, when ADME values are examined, it can be considered that quercetin is a useful and effective candidate compound in reducing arsenic toxicity, considering its higher synthetic accessibility score, better pharmacokinetic properties, and good biological transition and interaction capacities compared to succimer.
Citation - WoS: 8
Citation - Scopus: 3
Cardioprotectiveeffectsof Hypericumtriquetrifoliumturra. Against Cyclophosphamide Related Cardiotoxicity in Rats
(2018) Çetik Yıldız, Songül; Keskin, Cumali; Ayhanci, Adnan; Şahintürk, Varol; Yıldız, Songul Cetık; Keskin, Cumali; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
Cyclophosphamide (CYP) is commonly used as anticancer agent but its usage is limited by cardiotoxic side effects such as dose-dependent cardiac damage, morphologically defined necrosis and bleeding. Hypericum triquetrifoliumTurra. (HT) shows anti-oxidative and anticarciogenic properties with its rich phenolic contents. The current study was designed to investigate the possible protective effect of HT on CYP-induced cardiotoxicity. Albino ratswererandomlydividedinto9groups,eachincluded7animals.Serumcreatinekinase-MB(CK-MB), malondialdehyde (MDA), aspartate transaminase (AST), glutathione (GSH), total antioxidant (TAC) and total oxidant capacity (TOC) levels were investigated. Furthermore, the cardiac tissue samples were investigated histopatologically. While the levels of serum CK-MB, MDA, AST and TOC were high, the levels of serum GSH and TAC levels were low in the CYP groups. It was also observed that CYP-induced cardiotoxicity was dose dependent. In the treatment with CYP plus HT doses there was observed an essential decrease in the CYP cardiotoxicity; decreased cell damage and oxidative stress parameters and also increased GSH and TAC levels. Based on our findings, it can be proposed that HT seed methanol extract was a strong candidate in preventing the CYP-induced cardiotoxicity.
Celtis Tournefortii Lam Yaprak Özütünün Bileşenlerinin Lc-ms/ms Aracılığıyla Belirlenmesi, Enzim İnhibisyonunun, Antimikrobiyal ve Antikanser Etkilerinin Araştırılması
(2023) Keskin, Cumali; Baran, Ayşe; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
Bitkilerden elde edilen özütlerde bulunan fitokimyasallar çok önemli biyoaktif bileşenlerdir. Bu çalışmada, Celtis tournefortii Lam. ağacı (CT) yapraklarından elde edilen özüt içeriğindeki fitokimyasallar LC-MS yöntemi ile belirlendi. Rutin (2479.89 µg ml-1), kumarin (1241.68 µg ml-1), biyokanin A (1026.42 µg ml-1), şikimik asit (477.32 µg ml-1) ve klorojenik asit (300.76 µg ml-1) bileşenlerinin yüksek konsantrasyonlara sahip olduğu belirlendi. CT ekstraktının patojen suşların büyümesi üzerinde baskılayıcı etkileri mikrodilüsyon yöntemi ile çalışıldı. 2.00-8.00 µg ml-1 konsantrasyon aralığında suşlar üzerinde baskılamaya neden olduğu gözlendi. Özütün asetil kolinesteraz ve glutatyon-S transferaz enzim aktiviteleri üzerindeki inhibisyon etkileri incelendi ve enzim aktivitesinin %50 inhibitör değerleri sırasıyla 13.58 ve 13.86 olarak bulundu. 3-(4,5-dimetiltiazol-2-il)-2,5-difenil tetrazol bromür tekniği uygulanarak CT yaprak özütünün hücre canlılığını baskılayıcı etkileri yumurtalık, kolon ve beyin kanseri hücrelerinin yanı sıra sağlıklı cilt fibroblast hücrelerinde çalışıldı. Kanser hücrelerinde sırasıyla %42, %4.27 ve %14.29 oranında baskılama oluşturduğu gözlendi.
Celtis Tournefortii Lam. Bitkisinin Yeşil Yapraklarından Gümüş ve Altın Nanopartiküllerin Biyolojik Yolla Sentezi, Karakterizasyonu, Kimyasal Kompozisyon ve İn-vitro Antimikrobiyal ve Sitotoksik Aktivitelerinin Belirlenmesi
(2024) Keskin, Cumali; Baran, Ayşe; Keskin, Cumali; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
Celtis tournefortii Lam. (C.tournefortii) bitkisinin atık durumundaki yeşil yapraklarından elde edilen özüt kullanılarak iki farklı konsantrasyonda altın nanopartiküllerin (AuNP'lerin) ve gümüş nanopartiküllerin (AgNP'lerin) sentezi, ucuz, kolay ve çevre dostu bir yaklaşımla yapıldı. Sentez sonucunda elde edilen AuNP'lerin ve AgNP'lerin karakterizasyonu UV-vis Spektrofotometre, XRD, FTIR, TEM, AFM, FESEM, EDX, TGA-DTA, DLS cihazlarından elde edilen veriler aracılığıyla değerlendirildi. 5 ve 10 mM'da sentezlenen AuNP'lerin sırasıyla, küresel morfolojik görünümde, negatif yüzey yük dağılımında, 553.67-555.32 nm maksimum absorbansa sahip ve 31.30-53.55 nm boyut dağılımında oldukları belirlendi. 5 ve 10 mM'da sentezlenen AgNP'lerin sırasıyla, 479.10-482.13 nm maksimum absorbansta, negatif yüzey yük dağılımında, ortalama 4.8-15 nm boyutlarda ve küresel görünümde oldukları bulgusuna ulaşıldı. Elde edilen AuNP'lerin ve AgNP'lerin, in-vitro antimikrobiyal ve antikanser etkileri, sırasıyla mikrodilüsyon ve MTT metotları kullanılarak incelendi. Sentezlenen AuNP'lerin antibiyotiklerden daha düşük olan, 0.01 ve 0.50 µg mL-1 aralığındaki konsantrasyonların patojen mikroorganizmaların üremelerinin baskılamada etkili oldukları görüldü. AuNP'lerin 25 µg mL-1 konsantrasyonunun en iyi antikanser etkisi, % 88.58 oranında baskılama ile CaCo-2 hücre hattı üzerinde olduğu belirlendi. Diğer hücre hatlarının üremesi üzerinde de etkili baskılama oluştuğu tespit edildi. AgNP'lerin patojen suşların üremesi üzerindeki baskılayıcı etkisinin 0.03-1.00 µg mL-1 gibi düşük konsantrasyonlarda, standart antibiyotiklerden daha etkili oldukları görüldü. AgNP'lerin sağlıklı hücre hattı HDF üzerinde 25 µg mL-1 konsantrasyonun % 79.45 canlılık oranı ile toksik etkisinin nerdeyse olmadığı belirlendi. Kanser hücre hatlarında ise canlılığı baskılamada en iyi etkinin, % 75.36 baskılama oranıyla CaCo-2 hücre hattı üzerinde oluşturduğu belirlendi. Bunun yanında diğer kanser hücreler hatlarının üremesi üzerinde önemli düzeyde baskılama meydana getirdi. C. tournefortii özütünün fitokimyasal bileşen bakımından karakterize edilmesi için, LC-MS/MS verilerinden elde edilen profil kullanıldı. Profilde en yüksek konsantrasyona sahip olan bileşenlerin sırasıyla, rutin, kumarin, biosiyanin A, şikimik asit, klorojenik asit olduğu belirlendi. Ayrıca özütün antimikrobiyal ve antikanser etkileri de incelendi. Özütün, AgNP'ler ve AuNP'lere kıyasla daha yüksek konsantrasyonda daha az etki gösterdiği belirlendi.
Cennet Hurması (Diospyros kaki) meyvesinin yeşil yapraklarından sentezlenen gümüş nanopartiküllerin sentezi, karekterizasyonu, antimikrobiyal ve sitotoksik aktivitelerinin incelenmesi
(Mardin Artuklu Üniversitesi, 2022) Keskin, Cumali; Keskin, Cumali; Department of Medical Services and Techniques / Tıbbi Hizmetler ve Teknikleri Bölümü
Bu çalışmada Cennet Hurması meyvesinin yeşil yaprakları ile elde edilen özüt ve 5 MilliMolar gümüş nitrat çözeltisi 5: 1 oranında cam bir kap içerisinde reaksiyona bırakıldı. Reaksiyon sonucunda nano partiküller (AgNP'ler) çevre dostu yöntemle ekonomik ve basit bir biçimde sentezlendi. Sentezlenen AgNP'ler UV-visiblespektrofotometre (UV-Vis.), Fourier Transform İnfrared Spectroscopy (FTIR), X- Işınımı Kırınımı Difraktrometresi(XRD), Taramalı Electron Mikroskobu (SEM), Zeta potansiyeli ve Zetasizer cihaz verileri kullanılarak karakterize edildi. Karakterizasyon verilerine göre 453 nm dalga boyunda maksimum absorbans, küresel görünüm, 7-20 nm arasında kristal nano boyuta sahip, -19.9 mV zeta potansiyeline sahip oldukları belirlendi. AgNP'lerin patojen gram negatif ve pozitif bakteriler ile mayanın üremeleri üzerinde baskılayıcı etkileri mikro dilusyon yöntemi ile Minimum İnhibisyon Konsantrasyonu (MİK) tespit edildi. Partiküllerin sitotoksik etkileri sağlıklı hücre hattı (HDF) ve kanserli hücre hatları (U118, CaCo-2 ve Skov-3) ile incelendi.